陈文青
性别:男
职务/职称:生物药学系主任/教授、博士生导师
通讯地址:9778818威尼斯(办公地址: 9778818威尼斯文理学部测试中心C-406)
E-mail: wqchen@whu.edu.cn
Orcid: https://orcid.org/0000-0003-2557-8960
学习与工作简历
2011-至今:9778818威尼斯,历任副教授与教授
2013-2014:美国加州大学洛杉矶分校(UCLA),博士后(CSC Scholarship)
2009-2011:上海交通大学微生物代谢国家重点实验室,博士后
2005-2009:上海交通大学,博士
获奖情况
1. 首届合成生物学竞赛创新赛大奖(唯一最高奖项)、最佳团队奖、
最佳答辩奖及金奖等四项桂冠(指导教师)
2. 湖北省医学青年拔尖人才(中期考核优秀)
3. 9778818威尼斯2017-2018学年本科优秀教学业绩奖(专业理论课程类)
4. 9778818威尼斯2018届优秀学士学位论文(指导教师)
5. 9778818威尼斯2017届优秀学士学位论文(指导教师)
6. 七届9778818威尼斯朱裕壁医学奖
7. 9778818威尼斯优秀教学研究论文一等奖
8. 武汉市青年科技晨光计划
9. 世界大学生药苑论坛创新成果二等奖(指导教师)
10. 9778818威尼斯珞珈青年学者
11. 上海交通大学赵朱木兰奖学金
12. 上海交通大学优秀博士学位论文奖励基金
业绩概要
课题组长期专注(但不局限)于重要核苷类功能分子的生物合成与合成生物学研究;近年来,在重要天然核苷类功能分子基因(簇)资源的发掘、酶学机理的阐明、重要核苷类药物及其中间体的绿色生物智造以及新型核苷类功能分子人工合成途径的创建与应用方面展开了较为系统的研究;曾在Nature Communications、Biotechnology Advances、ACS Catalysis、Protein & Cell、Chemical Science、Cell Chemical Biology、Metabolic Engineering、iScience、J. Biol. Chem、Biotechnology & Bioengineering、Applied and Environmental Microbiology及Microbial Cell Factories等杂志上发表论文40余篇;独立开展研究以来,主持国家自然科学基金面上项目、973(重点研发)计划子课题等若干项,并与多个知名生物制药企业建立了深度战略合作关系。
研究方向与兴趣
1. 重要核苷类功能分子(侧重天然药物)的生物合成
基于基因组大数据,高效发掘具有自主知识产权的重要核苷类功能分子(聚焦但不局限)及相关基因(酶)资源,积极参与国际竞争;与此同时,汇聚多学科研究手段,对活性显著、结构独特的重要天然药物(生物功能分子)的生物合成机理进行探究,以破解药物分子合成过程中神奇的化学与生物学之谜。
2. 重要核苷类功能分子的生物智造
以创造更卓越“大健康”产品、突破“卡脖子”技术为奋斗目标,实现重要核苷类功能分子(药物及其中间体、精细化学品与食品添加剂/功能因子等)的合成生物学智造,进而提升相关产业的技术水平与国际竞争力;此外,与著名生物制药企业深度合作,系统解析目标药物合成途径与代谢网络,通过合成生物学策略,定向提高目标药物(有效组分)的产量和质量,从而直接服务于工业化生产。
3. 重要核苷类功能分子的生理功能与生物代谢
聚焦大健康科学问题,以“基础-应用”的多学科深度合作为驱动力,从分子水平上揭示核苷类功能分子的生理与代谢过程,同时百倍努力,力争为我国大健康产业的发展贡献力量;此外,瞄准医学科学前沿,以生物功能分子的代谢生物学研究为突破口,通过阐明临床核苷类药物(抗病毒与抗肿瘤等)与目标生物功能分子的分子代谢机制,从而为相关疾病的临床治疗提供理论指导与科学依据。
国际合作
1.美国农业部农业研究服务中心(USDA-ARS)Neil P.J. Price博士
2.奥地利工业生物技术研究中心Margit Winkler博士
主讲课程
本科生: 微生物药物学;研究生:生物药学研究进展。
国家发明专利
1. 陈文青,于乐,邓子新,高耀杰,刘洋;一种生产5-甲基尿苷的基因工程菌及其应用,申请号:202210021004.2。
2. 陈文青,于乐,邓子新,周文婷,佘一玄;一种植物细胞分裂素狭霉素的生物合成基因簇及其生物材料以及在合成狭霉素中的应用,专利号:ZL202110689402.7。
3. 陈文青,孔丽媛,邓子新,徐顾丹,刘小琴,王静雯,唐曾琳;最小霉素生物合成基因簇、重组菌及其应用,专利号:ZL201911156223.6。
4. 陈文青,高耀杰,邓子新,徐顾丹,巫攀;2′-氯代喷司他丁和2′-氨基-2′-脱氧腺苷生物合成基因簇及其应用,专利号:ZL201710054193.2。
5. 陈文青,巫攀,邓子新,万丹,徐顾丹;喷司他丁和阿糖腺苷生物合成基因簇及其应用,专利号:ZL201611181302.9。
6. 陈文青,祁建钊,邓子新,刘进;肽基核苷类杂合抗生素Nikkoxin E和Nikkoxin F及其制备方法,专利号:ZL201510033114.0。
7. 陈文青,邓子新,翟李鹏,程放;多氧霉素与尼可霉素杂合抗生素及其制备方法,专利号:ZL201210049728.4。
代表性研究论文
1. Gong et al., (2023) Coming soon!
2. Yu et al., (2023) Coming soon!
3. Zhai G#, Gong R#, Lin Y, Zhang M, Li J, Deng Z, Sun J, Chen W*, Zhang Z*. (2022) Structural insight into the catalytic mechanism of non-heme iron halogenase AdaV in 2′-chloropentostatin biosynthesis. ACS Catal. 12:13910-13920. (*共通讯作者)
4. Zhang M#, Kong L#, Gong R#, Iorio M, Donadio S, Deng Z, Sosio M, Chen W*. (2022). Biosynthesis of C-nucleoside antibiotics in actinobacteria: recent advances and future developments. Microb Cell Fact. 21(1):2. (*通讯作者)
5. Yu L#, Zhou W#, She Y#, Ma H, Cai Y-S, Jiang M, Deng Z, Price NPJ*, Chen W*. (2021) Efficient biosynthesis of nucleoside cytokinin angustmycin A containing an unusual sugar system. Nat Commun. 12(1):6633. (*共通讯作者)
6. Gong R#, Yu L#, Qin Y, Price NPJ, He X, Deng Z*, Chen W*. (2021) Harnessing synthetic biology-based strategies for engineered biosynthesis of nucleoside natural products in actinobacteria. Biotechnol Adv, 46:107673. (*共通讯作者)
7. Zhang M#, Zhang P#, Xu G#, Zhou W, Gao Y, Gong R, Cai Y-S, Cong H, Deng Z, Price NPJ, Mao X*, Chen W*. (2020) Comparative investigation into formycin A and pyrazofurin A biosynthesis reveals branch pathways for the construction of C-nucleoside scaffolds. Appl Environ Microbiol. 86(2). (*共通讯作者)
8. Kong L#, Xu G#, Liu X#, Wang J, Tang Z, Cai Y-S, Shen K, Tao W, Zheng Y, Deng Z, Price NPJ, Chen W*. (2019) Divergent biosynthesis of C-nucleoside minimycin and indigoidine in bacteria. iScience (Cell子刊), 22:430-440. (*通讯作者)
9. Xu G , Kong L, Xu L, Gao Y, Jiang M, Cai Y-S, Hong K, Hu Y, Liu P, Deng Z, Price NPJ, Chen W*. (2018) Coordinated biosynthesis of the purine nucleoside antibiotics aristeromycin and coformycin in Actinomycetes. Appl Environ Microbiol. 84(22). (*通讯作者)
10. Liu Y, Gong R, Liu X, Zhang P, Zhang Q, Cai Y-S, Deng Z, Winkler M, Wu J*, Chen W*. (2018) Discovery and characterization of the tubercidin biosynthetic pathway from Streptomyces tubercidicus NBRC 13090. Microb Cell Fact. 17:131. (*共通讯作者)
11. Gong R, Qi J, Wu P, Cai Y-S, Ma H, Liu Y, Duan H, Wang M, Deng Z, Price NPJ, Chen W*. (2018) An ATP-dependent ligase with substrate flexibility involved in assembly of the peptidyl nucleoside antibiotic polyoxin. Appl Environ Microbiol. 84(13). (*通讯作者)
12. Gao Y#, Xu G#, Wu P#, Liu J, Deng Z, Chen W*. (2017) Biosynthesis of 2′-chloropentostatin and 2′-amino-2′-deoxyadenosine highlights a single gene cluster responsible for two individual pathways in Actinomadura sp. ATCC 39365. Appl Environ Microbiol. 83(10). (*通讯作者)
13. Wu P#, Wan D#, Xu G #, Wang G, Ma H, Wang T, Gao Y, Qi J, Chen X, Zhu J, Li Y-Q, Deng Z, Chen W*. (2017) An unusual protector-protégé strategy for the biosynthesis of purine nucleoside antibiotics. Cell Chem Biol (Cell子刊). 24(2):171-181 (*通讯作者)
14. He N#, Wu P#, Lei Y, Xu B, Zhu X, Xu G, Gao Y, Qi J, Deng Z, Tang G, Chen W*, Xiao Y*. (2017) Construction of the octosyl acid backbone catalyzed by a radical S-adenosylmethionine enzyme and a phosphatase in the biosynthesis of high-carbon sugar nucleoside antibiotics. Chem Sci. 8:444-451. (*共通讯作者)
15. Zhao H, Wang L, Wan D, Qi J, Gong R, Deng Z, Chen W*. (2016) Characterization of the aurantimycin biosynthetic gene cluster and enhancing its production by manipulating two pathway-specific activators in Streptomyces aurantiacus JA 4570. Microb Cell Fact. 15:160. (*通讯作者)
16. Qi J, Wan D, Ma H, Liu Y, Gong R, Qu X, Sun Y, Deng Z, Chen W*. (2016) Deciphering carbamoylpolyoxamic acid biosynthesis reveals unusual acetylation cycle associated with tandem reduction and sequential hydroxylation. Cell Chem Biol (Cell子刊). 23(8):935-944. (*通讯作者) (Featured as Issue Highlights in Cell Chem Biol)
17. Chen W#, Li Y#, Li J, Wu L, Li Y, Wang R, Deng Z, Zhou J. (2016) An unusual UMP C-5 methylase in nucleoside antibiotic polyoxin biosynthesis. Protein Cell. 7(9):673-683. (#共第一作者)
18. Chen W, Qi J, Wu P, Wan D, Liu J, Deng Z. (2016) Natural and engineered biosynthesis of nucleoside antibiotics in Actinomycetes. J Ind Microbiol Biotechnol. 43(2-3):401-17.
19. Qi J, Liu J, Wan D, Wang Y, Cai Y, Feng X, Wu P, Li S, Qiu G, Yang S, Chen W*, Deng Z. (2015) Metabolic engineering of an industrial polyoxin producer for the targeted overproduction of designer nucleoside antibiotics. Biotechnol Bioeng. 112(9):1865-1871. (*通讯作者) (Featured as Spotlight in Biotechol Bioeng)
20. Chen W, Dai D, Wang C, Huang T, Zhai L, Deng Z. (2013) Genetic dissection of the polyoxin building block-carbamoylpolyoxamic acid biosynthesis revealing the "pathway redundancy" in metabolic networks. Microb Cell Fact. 12:121. (Most accessed paper, Top 2)
21. Xu D, Liu G, Cheng L, Lu X, Chen W*, Deng Z*. (2013) Identification of Mur34 as the novel negative regulator responsible for the biosynthesis of muraymycin in Streptomyces sp. NRRL 30471. PLoS One. 8(10):e76068 (*共通讯作者)
22. Zhai L, Lin S, Qu D, Hong X, Bai L, Chen W*, Deng Z*. (2012) Engineering of an industrial polyoxin producer for the rational production of hybrid peptidyl nucleoside antibiotics. Metab Eng. 14(4):388-93. (*共通讯作者)
23. Doroghazi J, Ju K, Brown D, Labeda D, Deng Z, Metcalf W, Chen W*, Price NPJ*. (2011) Genome sequences of three tunicamycin-producing Streptomyces strains; S. chartreusis NRRL 12338, S. chartreusis NRRL 3882, and S. lysosuperificus ATCC 31396. J Bacteriol. 193(24):7021-2. (*共通讯作者)
24. Cheng L, Chen W*, Zhai L, Xu D, Huang T, Lin S, Zhou X, Deng Z*. (2011) Identification of the gene cluster involved in muraymycin biosynthesis from Streptomyces sp. NRRL 30471. Mol Biosyst. 7(3):920-927. (*共通讯作者)
25. Chen W#, Qu D#, Zhai L, Tao M, Wang Y, Lin S, Price NPJ, Deng Z. (2010) Characterization of the tunicamycin gene cluster unveiling unique steps involved in its biosynthesis. Protein Cell. 1(12):1093-1105. (#共第一作者)
26. Chen W, Huang T, He X, Meng Q, You D, Bai L, Li J, Wu M, Li R, Xie Z, Zhou H, Zhou X, Tan H, Deng Z. (2009) Characterization of the polyoxin biosynthetic gene cluster from Streptomyces cacaoi and engineered production of polyoxin H. J Biol Chem. 284(16): 10627-10638.