职称或职务: 副教授
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学习简历
1998.9―2002.8 山东大学 攻读生物技术专业学士学位
2002.9―2008.8 上海交通大学 攻读微生物学专业博士学位
工作简历
2008.9―2011.8 布朗大学 化学系 Post doctoral research associate
2011.9至今 9778818威尼斯 9778818威尼斯 副教授
业绩概要
对具有重要基础和应用价值的活性天然产物的生物合成机制及其分子改造进行了多年的探索和积累，在国外权威学术期刊，如“Journal of the American Chemical Society”、“Biochemistry”、 “Journal of Bacteriology”发表研究论文多篇。
研究领域
天然产物生物合成的分子遗传学、生物化学及组合生物合成
研究兴趣与方向
从微生物中寻找具有重要基础研究和实际应用价值的活性天然产物，调取参与天然产物生物合成的基因簇，通过体内遗传学研究和体外生物化学研究，探索活性天然产物的生物合成途径以及酶催化机制。希望在分子水平上解决一些基础科学研究的问题，为酶催化产物改造提供理论依据，同时也为天然产物的人工改造，发现和筛选新药提供更有效的，更有针对性的途径和方法。
微生物同样存在复杂而有序的调节网络，对环境、群体、以及细胞内的各种变化做出反应，调节细胞内的主代谢、次生代谢、和形态分化。通过对调节基因的研究，一方面可以完善微生物细胞内的调控网，了解各种代谢途径是如何互相影响形成有机的整体。另一方面，对调节基因改造是提高抗生素产量的最直接最有效的途径之一，有非常重要的应用价值。
已发表的学术论文
Qiu J, Zhuo Y, Zhu D, Zhou X, Zhang L, Bai L, Deng Z. Overexpression of the ABC transporter AvtAB increases avermectin production in Streptomyces avermitilis. Appl Microbiol Biotechnol. 2011 Oct;92(2):337-45.
Zhu D*, Seo MJ*, Ikeda H, Cane DE. Genome mining in streptomyces. Discovery of an unprecedented P450-catalyzed oxidative rearrangement that is the final step in the biosynthesis of pentalenolactone.（*, co-first author） J Am Chem Soc. 2011 Feb 23;133(7):2128-31.
Seo MJ*, Zhu D*, Endo S, Ikeda H, Cane DE. Genome mining in Streptomyces. Elucidation of the role of Baeyer-Villiger monooxygenases and non-heme iron-dependent dehydrogenase/oxygenases in the final steps of the biosynthesis of pentalenolactone and neopentalenolactone.（*, co-first author） Biochemistry. 2011 Mar 15;50(10):1739-54.
Zhao C, Coughlin JM, Ju J, Zhu D, Wendt-Pienkowski E, Zhou X, Wang Z, Shen B, Deng Z. Oxazolomycin biosynthesis in Streptomyces albus JA3453 featuring an "acyltransferase-less" type I polyketide synthase that incorporates two distinct extender units. J Biol Chem. 2010 Jun 25;285(26):20097-108.
He Y, Zhu D, Bai L, Deng Z. Cloning of Antibiotic Biosynthetic Gene clusters from Genomic library by Narrow-down PCR. JOURNAL OF SHANGHAI JIAOTONG UNIVERSITY. 2009; 43(1):5-8. Chinese
Zhu D, He Y, Bai L, Deng Z. Positive Regulation of Avermectin Biosynthesis by AveR in Streptomyces avermitili. JOURNAL OF SHANGHAI JIAOTONG UNIVERSITY. 2008; 42(9):1448-1452. Chinese
Zhu D, He X, Zhou X, Deng Z. Expression of the melC operon in several Streptomyces strains is positively regulated by AdpA, an AraC family transcriptional regulator involved in morphological development in Streptomyces coelicolor. J Bacteriol. 2005 May;187(9):3180-7.
Zhang X, Zhu D, Wang D, Lin J, Qu Y, Yu S. [Study on xylose fermentation by Neurospora crassa].Wei Sheng Wu Xue Bao. 2003 Aug;43(4):466-72. Chinese.
Zhang X, Zhu D, Wang D, Lin J, Qu Y, Yu S. [Production and Some Properties of Xylanase from Neurospora crassa]. JOURNAL OF CELLULOSE SCIENCE AND TECHNOLOGY . 2002; 10(04). Chinese
国际合作
布朗大学化学系教授, Vernon K. Krieble 化学教授和生化教授David E. Cane (http://www.chem.brown.edu/Faculty/dec/dec.html/)
